Năm 1984, một công ty làm việc cho hãng Microsoft đã cho phát hành phiên bản đầu tiên của Microsoft Project chạy trên hệ điều hành DOS. Microsoft đã mua lại toàn bộ bản quyền phần mềm này và phát hành phiên bản 2 vào năm 1985. Phiên bản 3 dành cho DOS, được phát hành vào năm 1986. Phiên bản 4 cho DOS (Project 4.0 for DOS) là phiên bản DOS cuối cùng, phát hành năm 1986. Phiên bản dùng cho Windows đầu tiên đã được phát hành vào năm 1990, và được đặt tên là Version 1 for Windows.

Phiên bản đầu tiên dùng cho máy vi tính Macintosh (chạy hệ điều hành Mac OS) đã được phát hành vào năm 1991, và tiếp tục phát triển thành Project 4.0 for Mac vào năm 1993. Nhưng tới năm sau, năm 1994, Microsoft đã ngừng phát triển hầu hết các ứng dụng trên Mac và không đưa ra một phiên bản Project mới vào bộ Office cho đến năm 1998, sau khi một Microsoft Macintosh Business Unit (MacBU) mới được tạo ra vào năm 1993. MacBU không bao giờ còn phát hành và cập nhật các phiên bản Project nữa, và các phiên bản Project cho Mac, từ năm 1993 về trước, không thể chạy được trên Mac OS X nữa.

Các phiên bản Microsoft Project tiếp theo cho Windows đã được phát hành vào các năm 1992 (phiên bản 3), 1993 (phiên bản 4), 1995, 1998, 2000, 2002, 2003 và 2007.